Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnip2Q99JG7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnip2Q99JG7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnip2Q99JG7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnip2Q99JG7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnip2Q99JG7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnip2Q99JG7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnip2Q99JG7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnip2Q99JG7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnip2Q99JG7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnip2Q99JG7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnip2Q99JG7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnip2Q99JG7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnip2Q99JG7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnip2Q99JG7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnip2Q99JG7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnip2Q99JG7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnip2Q99JG7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnip2Q99JG7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnip2Q99JG7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnip2Q99JG7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnip2Q99JG7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnip2Q99JG7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnip2Q99JG7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnip2Q99JG7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms