Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddb2Q99J79 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms