Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Def8Q99J78 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Def8Q99J78 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms