Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tspan1Q99J59 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan1Q99J59 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms