Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CsprsQ99388 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CsprsQ99388 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms