Protein–RNA interactions for Protein: Q923U0

Tom1l1, TOM1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l1Q923U0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tom1l1Q923U0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tom1l1Q923U0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms