Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b5Q923D4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b5Q923D4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms