Protein–RNA interactions for Protein: Q921I2

Klhdc4, Kelch domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc4Q921I2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhdc4Q921I2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhdc4Q921I2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhdc4Q921I2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhdc4Q921I2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhdc4Q921I2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhdc4Q921I2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhdc4Q921I2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhdc4Q921I2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhdc4Q921I2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhdc4Q921I2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhdc4Q921I2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhdc4Q921I2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhdc4Q921I2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhdc4Q921I2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhdc4Q921I2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhdc4Q921I2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhdc4Q921I2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhdc4Q921I2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhdc4Q921I2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhdc4Q921I2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhdc4Q921I2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhdc4Q921I2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhdc4Q921I2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhdc4Q921I2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhdc4Q921I2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhdc4Q921I2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhdc4Q921I2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhdc4Q921I2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhdc4Q921I2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhdc4Q921I2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc4Q921I2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc4Q921I2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc4Q921I2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc4Q921I2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc4Q921I2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc4Q921I2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc4Q921I2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc4Q921I2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc4Q921I2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc4Q921I2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc4Q921I2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc4Q921I2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc4Q921I2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhdc4Q921I2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhdc4Q921I2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms