Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smc1bQ920F6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smc1bQ920F6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smc1bQ920F6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smc1bQ920F6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smc1bQ920F6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smc1bQ920F6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smc1bQ920F6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smc1bQ920F6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smc1bQ920F6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smc1bQ920F6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smc1bQ920F6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smc1bQ920F6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smc1bQ920F6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smc1bQ920F6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smc1bQ920F6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smc1bQ920F6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smc1bQ920F6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smc1bQ920F6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smc1bQ920F6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
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