Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx18Q91ZR2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx18Q91ZR2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx18Q91ZR2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx18Q91ZR2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx18Q91ZR2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx18Q91ZR2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms