Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atpaf2Q91YY4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atpaf2Q91YY4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atpaf2Q91YY4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atpaf2Q91YY4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atpaf2Q91YY4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atpaf2Q91YY4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atpaf2Q91YY4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atpaf2Q91YY4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atpaf2Q91YY4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atpaf2Q91YY4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atpaf2Q91YY4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atpaf2Q91YY4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atpaf2Q91YY4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atpaf2Q91YY4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atpaf2Q91YY4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atpaf2Q91YY4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atpaf2Q91YY4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atpaf2Q91YY4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms