Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD3

Tm4sf4, Transmembrane 4 L6 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf4Q91XD3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tm4sf4Q91XD3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm4sf4Q91XD3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms