Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD2

Trpv6, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 6, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv6Q91WD2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv6Q91WD2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv6Q91WD2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv6Q91WD2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv6Q91WD2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv6Q91WD2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv6Q91WD2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv6Q91WD2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv6Q91WD2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv6Q91WD2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv6Q91WD2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv6Q91WD2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpv6Q91WD2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpv6Q91WD2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpv6Q91WD2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpv6Q91WD2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpv6Q91WD2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpv6Q91WD2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpv6Q91WD2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpv6Q91WD2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpv6Q91WD2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpv6Q91WD2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpv6Q91WD2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpv6Q91WD2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpv6Q91WD2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpv6Q91WD2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpv6Q91WD2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpv6Q91WD2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpv6Q91WD2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpv6Q91WD2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms