Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csde1Q91W50 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csde1Q91W50 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csde1Q91W50 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csde1Q91W50 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csde1Q91W50 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csde1Q91W50 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csde1Q91W50 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csde1Q91W50 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csde1Q91W50 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csde1Q91W50 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csde1Q91W50 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csde1Q91W50 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csde1Q91W50 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csde1Q91W50 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csde1Q91W50 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csde1Q91W50 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csde1Q91W50 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csde1Q91W50 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Csde1Q91W50 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csde1Q91W50 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csde1Q91W50 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csde1Q91W50 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms