Protein–RNA interactions for Protein: Q91V61

Sfxn3, Sideroflexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn3Q91V61 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfxn3Q91V61 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfxn3Q91V61 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms