Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fyco1Q8VDC1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fyco1Q8VDC1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fyco1Q8VDC1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms