Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn4Q8VCH8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
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Ubxn4Q8VCH8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ubxn4Q8VCH8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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