Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdh10Q8VCH7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdh10Q8VCH7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdh10Q8VCH7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Rdh10Q8VCH7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh10Q8VCH7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh10Q8VCH7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Rdh10Q8VCH7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh10Q8VCH7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Rdh10Q8VCH7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh10Q8VCH7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh10Q8VCH7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Rdh10Q8VCH7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh10Q8VCH7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh10Q8VCH7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh10Q8VCH7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh10Q8VCH7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh10Q8VCH7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh10Q8VCH7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh10Q8VCH7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Rdh10Q8VCH7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh10Q8VCH7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh10Q8VCH7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh10Q8VCH7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Rdh10Q8VCH7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh10Q8VCH7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh10Q8VCH7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh10Q8VCH7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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Rdh10Q8VCH7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdh10Q8VCH7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdh10Q8VCH7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Rdh10Q8VCH7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rdh10Q8VCH7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rdh10Q8VCH7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh10Q8VCH7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh10Q8VCH7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Rdh10Q8VCH7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh10Q8VCH7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Rdh10Q8VCH7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Rdh10Q8VCH7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Rdh10Q8VCH7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh10Q8VCH7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh10Q8VCH7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh10Q8VCH7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh10Q8VCH7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh10Q8VCH7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh10Q8VCH7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh10Q8VCH7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh10Q8VCH7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Rdh10Q8VCH7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh10Q8VCH7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh10Q8VCH7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Rdh10Q8VCH7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh10Q8VCH7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh10Q8VCH7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh10Q8VCH7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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