Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BbxQ8VBW5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BbxQ8VBW5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms