Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup35Q8R4R6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms