Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ccdc12Q8R344 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms