Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b4Q8QZY9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms