Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defb12Q8K4N3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defb12Q8K4N3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defb12Q8K4N3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defb12Q8K4N3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defb12Q8K4N3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defb12Q8K4N3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defb12Q8K4N3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defb12Q8K4N3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defb12Q8K4N3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defb12Q8K4N3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.8 ms