Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MyripQ8K3I4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MyripQ8K3I4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms