Protein–RNA interactions for Protein: Q8K304

Tmem129, E3 ubiquitin-protein ligase TM129, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem129Q8K304 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem129Q8K304 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem129Q8K304 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem129Q8K304 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem129Q8K304 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem129Q8K304 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem129Q8K304 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem129Q8K304 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem129Q8K304 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem129Q8K304 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem129Q8K304 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem129Q8K304 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem129Q8K304 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms