Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ncapd2Q8K2Z4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms