Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Neil3Q8K203 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil3Q8K203 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms