Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LgsnQ8CIX8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LgsnQ8CIX8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms