Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syne4Q8CII8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syne4Q8CII8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms