Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIG8

Prmt5, Protein arginine N-methyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt5Q8CIG8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prmt5Q8CIG8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Prmt5Q8CIG8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prmt5Q8CIG8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms