Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nupl2Q8CIC2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nupl2Q8CIC2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms