Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upp2Q8CGR7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms