Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm28Q8CGC6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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