Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ClasrpQ8CFC7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms