Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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Usp27Q8CEG8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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Usp27Q8CEG8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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Usp27Q8CEG8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
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Usp27Q8CEG8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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Usp27Q8CEG8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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Usp27Q8CEG8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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Usp27Q8CEG8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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Usp27Q8CEG8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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Usp27Q8CEG8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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Usp27Q8CEG8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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Usp27Q8CEG8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp27Q8CEG8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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