Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup88Q8CEC0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup88Q8CEC0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms