Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef8Q8CE24 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef8Q8CE24 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms