Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ufl1Q8CCJ3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ufl1Q8CCJ3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ufl1Q8CCJ3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms