Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nhsl1Q8CAF4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nhsl1Q8CAF4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms