Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek11Q8C0Q4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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