Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Strip1Q8C079 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms