Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps6ka5Q8C050 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka5Q8C050 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms