Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TnrQ8BYI9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TnrQ8BYI9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TnrQ8BYI9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms