Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp5Q8BX09 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms