Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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Usp38Q8BW70 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp38Q8BW70 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp38Q8BW70 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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