Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmod1Q8BVA4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod1Q8BVA4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms