Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130116L18RikQ8BMV6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms