Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKD6

Rnf144b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144B, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144bQ8BKD6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rnf144bQ8BKD6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rnf144bQ8BKD6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rnf144bQ8BKD6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rnf144bQ8BKD6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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