Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX3

Lrtm2, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm2Q8BGX3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm2Q8BGX3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm2Q8BGX3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms