Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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